Yumurtalık Kisti Ameliyatı, yumurtalık kistlerinin çıkarılması için açık ya da laparoskopik (Kapalı) ameliyat yöntemleri kullanılmaktadır. Çoğunlukla açık ya da lapraskopik yöntemin uygulanması yumurtalıktaki mevcut olan kistlerin boyutlarına ve ameliyat olacak hastanın farklı özelliklerine göre planlanarak seçilmektedir. Yumurtalık kisti ameliyatlarında her zaman hastalara kistektomi uygulanmaz kısacası yalnızca kist alınmaz. Bazı durumlarda yumurtalık ile kist birlikte alınırken, bazı durumlarda hem kist ile yumurta hem de rahim beraberinde alınmaktadır. Mesela kanser türünde meydana gelen durumlarda yumurtalık kistleri ile yumurtalık ve rahim tamamen çıkarılmaktadır. Genellikle iyi huylu olan kistlerde yalnızca kistin alınma durumu mümkün olmayabilmektedir. Çünkü kistin etrafında meydana gelen yapışıklıkdan kaynaklı olan ya da yumurtalıklarda herhangi bir sağlam doku tespiti yapılmaz ise ameliyat sırasında hem kist hem de yumurtalık beraberinde alınır. Hastaya uygulanan kistektomi ameliyatı yaklaşık olarak 1 saat sürmektedir. Eğer yumurtalık kisti ameliyatı hastaya lapraskopik yöntem kullanılarak yapılmış ise hasta ertesi gün taburcu olurken, açık ameliyatta hastane çıkışı 2 ya da 3 gün sürebilmektedir.